工藤新一は本作の主人公・江戸川コナンの正体です。頭脳明晰、容姿端麗の高校生探偵で数々の難事件を解決し、「日本警察の救世主」「平成のシャーロック・ホームズ」などと称される天才的推理力の持ち主です。そんあ工藤新一について一部の人たちからは「作者と食べ物の好みや利き手の設定が同じなのがキモい」「男はこういう完璧イケメンキャラは好きじゃない」などという理由で嫌われています。

遠山和葉は、服部平次の幼馴染で、平次と同じ私立改方学園高等部2年です。「浪花の連続殺人事件」での初登場以来、全てのメディア作品を含め平次とのペアでの出演がほとんどです。そんな遠山和葉について一部の人たちからは「自分の非を一切認めないから」「可愛いけど度々ウザイ」などという理由で嫌われています。

世良真純は、毛利蘭たちのクラスに転校してきた女子高生探偵です。日本人の父と日本人とイギリス人のハーフの母を持つクォーターで、年の離れた兄が二人います。そんな世良真純について一部の人たちからは「ママの言いなりだから」「自分サイドの情報は明かさずコナンの情報は欲しがる」などの理由で嫌われているようです。

安室透とは、『名探偵コナン』に登場する喫茶店ポアロのアルバイト店員、私立探偵、毛利小五郎の弟子としての表の顔です。褐色肌と明るい色の髪、タレ目が特徴の青年で、容姿端麗で、園子や歩美も「イケメン(さん)」と絶賛しています。そんな安室透について一部の人たちからは「二度と映画に出ないでほしいし安室の女っつう害悪女絶滅してほしい」「キャラに罪はないが人気が出過ぎた弊害が大きすぎる」などの理由で嫌われているようです。

大岡紅葉は、京都泉心高校2年の17歳で、緩くウェーブのかかった明るい色のショートヘアと、派手めのネイルが特徴です。関西でトップクラスの財力を有する大岡家の令嬢で、伊織無我という執事を従えています。そんな大岡紅葉について一部の人たちからは「大してして可愛くないし、ただの嫌味たらしい女」「美人だけど、ちょっとうざい」などの理由で嫌われているようです。

灰原哀は、一見すると単にクールで大人びている小学生の美少女だが、その正体は黒の組織の元メンバーで、主人公･江戸川コナンと同じく幼児化しています。そんな灰原哀について一部の人たちからは「ツンデレな性格で素直じゃない」「うざい」「工藤新一と毛利蘭の恋を邪魔するから」などの理由で嫌われているようです。

江戸川コナンは、本作の主人公で、少年探偵団のリーダー格です。天才的な頭脳の持ち主である名探偵であり、幾多の難事件を持ち前の頭脳で解決してきました。そんな江戸川コナンについて一部の人たちからは「キザな性格」「少年探偵団に対して上から目線」「大人と接するときと子供と接するときで態度が全然違うから」などの理由で嫌われているようです。

キャンティは、黒の組織の幹部の一人である腕利きの女性スナイパーで、コルンとコンビを組んでいます。『ブラックインパクト！ 組織の手が届く瞬間』初登場時には八つ当たりでジンの愛車をぶん殴っていました。そんなキャンティについて一部の人たちからは「短気でうるさいから」「ベルモットと対立しているから」「平気で人殺しをするから」などの理由で嫌われているようです。

吉田歩美は、江戸川コナンを少年探偵団に誘った張本人であり、灰原哀が入団するまでは探偵団の紅一点です。おかっぱ頭にカチューシャを着けた好奇心旺盛な少女で、推理よりも謎解きの方が好みです。そんな吉田歩美について一部の人たちからは「ぶりっ子だから生理的に無理」「高そうな服で探偵団ごっこをしており、なおかつ一番足手まといだから」などの理由で嫌われているようです。

円谷光彦は、主人公・江戸川コナンの同級生で、少年探偵団のメンバーです。誰にでも敬語を使い、礼儀正しく博学な頭脳派。コナンと灰原哀が元々頭脳明晰な青年から幼児化しているために劣っているかのような描写もされるが、明らかに小学一年生としてはヤバいぐらいの知識量があり、時にコナンや灰原も驚く程の推理力を発揮することがあります。そんな円谷光彦について一部の人たちからは「小学生とは思えないほど頭がいい」「歩美か灰原のどちらが好きなのかハッキリしてほしい」など理由で嫌われているようです。

ウォッカは、主人公である江戸川コナンの宿敵である黒の組織の幹部メンバーです。ジンのサポートを主に担当しているが、コードネームを持たない格下のメンバー達の指揮を執る事もあります。そんなウォッカについて一部の人たちからは「ジンの顔色を窺っている」「ジンがいないと何もできない」などの理由で嫌われているようです。

ジンは、黒の組織の幹部で、主人公・江戸川コナン最大の宿敵です。取引現場を目撃した工藤新一を殴打し行動不能にさせた上でAPTX4869を飲ませた張本人でもあります。そんなジンについて一部の人たちからは「冷酷で怖すぎる」「ミスが多くて無能」などの理由で嫌われているようです。