草薙素子は、『攻殻機動隊』の主人公で、脳と脊髄の一部を除き全身を義体化したサイボーグの女性です。公安9課の現場指揮官「少佐」として、超ウィザード級のハッカースキルと高い戦闘能力、冷静沈着な判断力で電脳犯罪やテロに対処する、シリーズを象徴する存在です。しかし一部のファンからは「機械的で冷徹」「硬派すぎる」「媒体やシリーズによって性格が違い過ぎる」などと言われています。

茅葺よう子は、日本初の女性内閣総理大臣で、草薙素子率いる公安9課の再建を許可した中心人物であり、個別の11人事件や難民問題に翻弄されながらも、理性的で毅然とした態度を貫いた政治家として描かれています。しかし一部のファンからは「9課を自身の政治利用のために動かそうとする」「感情移入しにくい」などの声があがっています。

トグサは、公安9課に所属する、ほぼ生身の体を持つ新米隊員です。草薙素子に刑事としての能力を買われて引き抜かれ、9課で唯一の妻帯者として、人間の直感と高い推理力を武器に活躍します。バトーとコンビを組むことが多く、義体化の進んだメンバーの中で人間臭さを残す貴重な存在ですが、一部のファンからは「弱すぎて足手まとい」「 人間としての生身へのこだわりが強すぎ」などと言われています。

合田一人は、TVアニメ『攻殻機動隊 S.A.C. 2nd GIG』に登場する主要な敵役（ヴィラン）で、内閣情報庁の戦略影響調査会議で代表補佐官を務めるエリート官僚であり、物語の黒幕として公安9課と対立します。一部のファンからは「傲慢で、人を駒としてしか見ていない」「何より見た目が気持ち悪い」などの声があがっています。

パズは、公安9課のメンバーで、ナイフ戦や近接格闘、潜入調査を得意とする、寡黙でニヒルな雰囲気を持つ男性です。9課の中でも特に素早く動く、実力派の刑事として知られていますが、他のメンバーに比べて描写が少なく、ファンの間でもあまり話題にならないと言われています。

スキンヘッドの義眼男のボーマは、公安9課のメンバーで、陸軍空挺特科出身の元特殊部隊員です。爆発物や特殊工作のプロフェッショナルであり、ネットの検索・探索技術も高く、外見に反し、繊細な性格の持ち主です。地味な役回りが多く、他の派手なメンバーに隠れてしまうため、投票では最下位になることが多い不人気キャラです。

戸久良エカは、戸久良エレクトロニクス社長の娘で、16年前に「興国の旅団」に誘拐され、のちに沖縄沖の放射能除去プラントで発見されるという、物語の謎を解く重要な鍵となる人物です。しかし荒巻課長に嘘の素行調査報告をさせ、9課を窮地に陥れようとするなど、9課のイメージを汚した背信行為が理由で不人気なようです。

ホセ・アキラは、草薙素子の恋人である義体技師で、マーメイドレッグというプライベートブランドを展開する技術者で、クールな素子の人間味のある一面を引き出す重要なキャラクターです。しかし一部のファンからは「素子のキャラクター像を崩してる」「人間関係の深みが足りない」「素子に恋愛の必要性はない。だからいらないキャラ」などと言われています。

江崎プリンは『攻殻機動隊 SAC_2045』に登場する、新生公安9課の技術・メンテナンス担当スタッフです。15歳でMITに編入した天才少女で、タチコマの整備や情報収集を担い、バトーに対して特別な感情を抱くメガネっ娘ですが、一部のファンからは「あざとい萌え要素がウザい」「存在が出しゃばりすぎで余計なキャラだと思う」などと言われています。